نشأ قسم الصيدلانيات عام 1994 مع تأسيس الكلية كقسم مشترك يضم كل من الصيدلانيات Pharmaceutics, الأحياء الدقيقة الصيدلانيةPharmaceutical Microbiology والممارسات الصيدلانية Pharmacy Practice .يضم القسم الآن تخصصي الصيدلانيات Pharmaceutics والأحياء الدقيقة الصيدلانية Pharmaceutical Microbiology بعد فصل الممارسات الصيدلانية في العام 2015 م لتنضم الصيدلة السريرية في قسم جديد مع في قسم جديد السريرية والممارسات الصيدلانية.
تولى رئاسة القسم عدد من أعضاء هيئة التدريس بالقسم كالآتي :-
ب.ميرغني عبد الرحمن يوسف أغسطس 1994 – نوفمبر 2011 م.
د/حسب الرسول الفاضل حسن نوفمبر 2011 م-ابريل 2015 م.
د/ست البنات يس الصديق ابريل 2015 م –يوليو 2017 م.
أ.محمد عبد الرحمن محمد يوليو 2017 م - الان.